igomyway Meine bisherigen Erfahrungen mit den USB-HDD (zwei identische Gehäuse/HDD):
So lange es nur eine bestimmte/festgelegte Platte ist, hat Duplicati kein Problem. Im Wechsel mit einer Zweiten kam Duplicati mit den linux-internen Laufwerksbezeichnungen durcheinander. In meinem Fall - vermutlich wegen der "Hardwaregleichheit" - hat es die immer für ein und dieselbe HDD gehalten.
Hab's seitdem nicht mehr für USB getestet, aber Online @Hetzner/netcup/Magenta macht es einen guten Job (ssh/WebDAV).